Елена Алексеевна Пустовойтова родилась 11 августа 1954 года в Казахстане. Выпускница факультета журналистики Казахского государственного университета в Алма-Ате.
В 1996 году, будучи заместителем редактора газеты «Экономика сегодня», закрытой властями за оппозиционность, была вынуждена покинуть Казахстан. 12 лет прожила в Австралии, в Сиднее, где редактировала газету «Единение» – первую русскоязычную газету в этой стране, существующую с декабря 1950 года. Все эти годы она активно сотрудничала с российскими интернет-изданиями – «Русское Воскресение», «Радонеж», «Российская Федерация сегодня», в которых опубликовала многочисленные статьи о языке, культуре, литературе, истории России. Принята в Союз писателей России в 2005 году.
Приехав в Россию в 2008 году, выпустила сборник повестей «Эвкалипты под снегом» (АСТ) и роман «Запах полыни» («Вече»). Автор многочисленных публикаций в литературной периодике: альманахе «Полдень», журналах «Роман-газета», «Наследник» и др. Редактор отдела критики литературного интернет-журнала МОЛОКО.
В 2011 году была награждена премией «Имперская культура» им. Эдуарда Володина. Диплом лауреата Елене Алексеевне вручил Валентин Григорьевич Распутин.
Живет во Владимире.